医疗机构的医学实验室，主要包括生物安全二级实验室、基因扩增（PCR）实验室、化学合成实验室和细胞实验室等。实验室产生的废气主要包含有机废气、无机废气、气溶胶、病菌等，有机废气中的甲醛会对人体会产生多种危害，比如刺激呼吸系统，导致咳嗽、胸闷、呼吸不畅，以及对中枢神经产生一定影响，导致头晕、头痛等现象。同时作为白血病的诱因，甲醛在全世界范围内都是室内空气环境中的重要破坏因素。乙醛的特殊毒性效应，涉及致癌、遗传毒性和肝脏损害等方面，乙醛被国际癌症研究中心列为2B类致癌物质。通常医疗实验室产生的废气，采用活性炭吸附技术，经过通风柜排出室外，通风柜见上图2。

通风柜的结构是上下式，其顶部有排气孔，可安装风机。上柜中有导流板、吸附过滤装置、电路控制触摸开关、电源插座等，透视窗采用钢化玻璃，可左右或上下移动，供人操作。下柜采用实验边台样式，上面是台面，下面是柜体。台面可安装水管和龙头等。通风柜是医疗机构实验室通风常见设备。

在放射性药品的制备过程中，回旋加速器室中的加速器运行时会产生感生放射性气体、臭氧、氮氧化物，以及由于热中子俘获或原子核的散裂而产生放射性气体；在患者检查的过程中，对于静脉注射显像剂的患者，其排泄物尤其是尿液以及呼出的气体都含有一定的放射性， CT球管曝光所产生的X射线照射空气也可使空气中产生臭氧和氮氧化物；另外在核素治疗的过程中，患者在接受碘-131治疗后，其排泄物（尿液、唾液、汗液、粪便）以及呼出的气体中均含有碘-131，所以核素治疗专用病房的空气中也会含有一定量的碘-131气体。核医学废气主要采用活性炭吸附技术进行过滤处理。对于回旋加速器室可以通过内配预过滤、活性炭吸附段、高效过滤段的组合式通风净化箱进行处理。

放射性尘埃引起的大气污染，主要是CT、磁共振成像（MRI）、B超、直线加速器、回旋加速器等产生的放射性同位素形成的气溶胶。气溶胶的危害是气溶胶中的部分离子和元素对人体健康有很大的危害，如亚硝酸钠有致癌的作用，高浓度氟会引起氟牙症和氟骨症，汞会引起中枢和植物神经系统功能紊乱和肾、消化道等器官损害等。放射科产生的废气通常也采用活性炭吸附技术进行处理后，再通过风机排至室外。

医用真空吸引系统用于吸除患者体内的痰、血、脓及其他污物废液，作为医院医用气体系统中不可或缺的组成部分，医用真空系统中的医疗废气含有大量的细菌和病毒。真空吸引系统废气因为带有病毒或细菌，需要进行消杀后进行高空排放，目前消毒装置主要分为：高温灭菌类、紫外消毒类（纳米光触媒）、高效过滤类等处理技术措施。

中药代煎业务目前在各大中医院已经非常普及，中药的生产，包括中药材的提取、煎煮等过程，在这些过程中会产生大量的有机废气，并伴有细菌和恶臭气味产生，对周围环境和周边居民的生产生活产生重大影响。目前，国内外用于净化处理中药生产废气的技术有吸收法、吸附法、等离子体技术、光氧催化技术等。

2003年我国爆发“非典”，2019年年底爆发了新型冠状病毒肺炎，国内各地加强了应急医院、传染病医院、方舱医院的设计与建造。此类医疗建筑归类为呼吸科传染病医院。针对此类呼吸科传染病，国家相继出台多个防疫及治疗措施，其中包括通风空调技术措施。应急医院、传染病医院、方舱医院不同于普通的综合医院，综合医院按科室需要进行通风换气，呼吸科传染病医院每层按三区两通道，即清洁区、半污染区、污染区、医护通道、患者通道设置通风换气设施。每层的半污染区、污染区分区设置独立的排风系统，每间房间设置下排风口，排风口处设置高效过滤器，每层各个区的排风机高位设置（一般设置在屋顶），污染和半污染区均在排风机吸入口设置集成式的，含有粗、中、高效电子过滤器及紫外线消毒的综合处理设施，废气经过过滤、消毒后高空排放，排风口设置锥形风帽，高出屋面3m。